A Prime possui uma metodologia própria para elaboração de Especificação Funcional, baseada nas melhores práticas do mercado, além de utilizar os modelos de referência dos principais órgãos especializados no assunto.

Todo o processo e metodologia da Especificação Funcional é padronizado, incluindo a utilização de modelos de produtos e documentos pré-formatados e de técnicas específicas durante a elaboração e preenchimento.

O modelo de produtos e entregáveis, e o conjunto de etapas e atividades são flexíveis, permitindo sua adaptação à estrutura, à cultura organizacional e à metodologia adotada pelo cliente para desenvolvimento de sistemas, e também são ajustáveis ao tamanho, porte e complexidade dos projetos, visando otimizar a relação entre agilidade e qualidade.